Данные в LoRaWAN сетях надежно защищены от любого несанкционированного доступа. Это стало возможным благодаря применению достаточно простого, но эффективного решения, при котором шифрование происходит на двух независимых слоях: сетевом и прикладном с применением двух уникальных для каждого устройства AES-128 ключей. Шифрование происходит в соответствии с RFC-4493. Полезные данные (payload) шифруются непосредственно на конечном узле (end-node) и следуют весь свой путь от отправителя до получателя в зашифрованном виде.